Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.3Q85ZW6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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