Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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