Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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