Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssxb10Q6XAR7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms