Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms