Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms