Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms