Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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