Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Fbxo27Q6DIA9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Fbxo27Q6DIA9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Fbxo27Q6DIA9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Fbxo27Q6DIA9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fbxo27Q6DIA9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms