Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sbno1Q689Z5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sbno1Q689Z5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sbno1Q689Z5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sbno1Q689Z5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms