Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tbr1Q64336 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms