Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms