Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CenpjQ569L8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CenpjQ569L8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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CenpjQ569L8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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CenpjQ569L8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpjQ569L8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms