Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srek1ip1Q4V9W2 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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