Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9Q3V038 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ttc9Q3V038 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9Q3V038 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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