Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms