Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc177Q3UHB8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc177Q3UHB8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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