Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Parp8Q3UD82 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms