Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ulk3Q3U3Q1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ulk3Q3U3Q1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ulk3Q3U3Q1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ulk3Q3U3Q1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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