Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fndc4Q3TR08 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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