Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prr27Q3SYJ2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms