Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col24a1Q30D77 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms