Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Shisal1Q0VBP7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms