Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
StumQ0VBF8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
StumQ0VBF8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms