Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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