Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd8Q09XV5 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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