Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Nf1Q04690 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Nf1Q04690 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms