Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms