Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Psmb4P99026 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Psmb4P99026 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb4P99026 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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