Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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