Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcbP82349 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcbP82349 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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