Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms