Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo40P62932 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms