Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms