Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms