Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Efnb1P52795 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms