Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tnfsf9P41274 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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