Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms