Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VhlP40338 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VhlP40338 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VhlP40338 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 832.1 ms