Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PpargP37238 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PpargP37238 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms