Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms