Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BrafP28028 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BrafP28028 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BrafP28028 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BrafP28028 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BrafP28028 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BrafP28028 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BrafP28028 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BrafP28028 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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