Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms