Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms