Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PparaP23204 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PparaP23204 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PparaP23204 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PparaP23204 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms