Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms