Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms