Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18532 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18532 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18532 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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