Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxb1P17919 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxb1P17919 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxb1P17919 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxb1P17919 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxb1P17919 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxb1P17919 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxb1P17919 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms