Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RhoP15409 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RhoP15409 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RhoP15409 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RhoP15409 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RhoP15409 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms